Bij de navelstrengpuctie wordt uit de navelstrengader bloed van de baby afgenomen. Dit bloed kan net als na de geboorte op van alles worden onderzocht. Het risico van de navelstrengpunctie is vergelijkbaar met de vlokkentest, 0,5 tot 1%. Deze ingreep kan plaatsvinden vanaf de 18e zwangerschapsweek. De uitslag is binnen enkele dagen bekend.
Een navelstrengpunctie wordt uitgevoerd als het vermoeden bestaat dat er iets niet in orde is met je baby, zoals: